阿奎納多等了一個多星期，才總算是等到了美國政府的正式代表塔夫脫。在這期間，那些一直等在馬尼拉外圍的菲律賓起義軍早就等不下去了，如果不是阿奎納多盡力彈壓，只怕那些傢伙們早就等不住，要搞出什麼亂子來了。說起來阿奎納多還真是不容易，因爲在馬尼拉外圍的部隊除了阿奎納多的嫡系之外，還有一大堆的其他部族的武裝，他們當初跑到這裡來，就是聽了阿奎那多的關於進了馬尼拉，好處大大的有，總的來說，就是“我要什麼就是什麼，我歡喜誰就是誰”。
可誰知道，到了馬尼拉城外，西班牙人也確實都被打垮了，但是美國人卻死死地霸佔着馬尼拉，就是不讓大家進去。眼看着都這麼多天了，美國人在那裡面，有這麼多天，只怕是什麼東西都搬光了，再拖個幾天，等進去了，只怕馬尼拉城裡面毛都剩不下兩根了，所以這些傢伙都鼓譟着要衝進城裡去。甚至不僅僅是那些部族武裝，就算是阿奎納多自己的嫡系，也一樣受到了這種想法的影響，多次要求進城。阿奎納多花了好大的力氣才把這些異動安撫下去。如果塔夫脫再晚來一段時間，他還真不知道事情會發生什麼樣的而變化。
得知塔夫脫來了，阿奎納多自然是趕緊去找他，看看他能給自己一個什麼樣的答覆。
“您說菲律賓獨立建國？”在阿奎納多說明了自己的來意之後，塔夫脫似乎很驚訝。
“是呀，您們不是宣傳呀反對殖民主義嗎？”
“這當然沒錯，但是你們獨立建國的條件還不成熟。”塔夫脫回答說，“首先，你應該知道，西班牙將菲律賓作價兩千萬出售給了美國政府。如果你們要獨立，這兩千萬美元總不能讓美國政府替你們出吧？而且，此前發生過的人道主義悲劇也證明了，你們菲律賓人缺乏文明素質，暫時還沒有建立獨立國家的資質。我認爲以菲律賓人現在的素質水平，暫時無法行使作爲國家主人權力的能力，因此需要由美國領導你們對你們的素質進行訓練、教導，以開化民心。從而讓你們成爲真正的文明人，然後，才能談得上獨立建國的事情。另外，既然戰爭已經結束了，那麼有一件事情，我們必須立刻處理一下。阿奎納多先生，在戰爭中，我們借給你們一些武器，對吧。既然戰爭結束了，這些武器也該歸還給我們了。而且從前一段時間您們的表現來看，武器這樣危險的東西，你們最好還是不要亂玩。正好，您的軍隊就在馬尼拉附近。只要你們把武器交還給我們。我們當然就會允許你們進入馬尼拉……”
這些話就像一個大棒一樣重重的敲在了阿奎納多的腦袋上，幾乎把他給打蒙了過去。他甚至都不記得自己是怎麼離開那個美國佬住着的地方了，似乎自己是和那個美國佬爭吵了起來，然後被扔了出來，又好像是自己唯唯諾諾的什麼都沒敢說，就這樣被打發出來了。但無論如何，有一點是可以確認的，那就是，曾經有一座金山似乎就在他的面前，等他跑過去的時候，卻發現這金山被另一個強盜搶走了。連那怕一個金幣都沒有給他剩下。甚至於，那個強盜居然還要收繳他們的槍支。顯然，如果真的把槍還給了那些美國佬，天知道會有什麼結果。這些白種人真是沒一個好東西！
……
阿奎納多帶回來的消息自然是讓菲律賓起義軍一片譁然。大家誰都想不到，打了那麼久的仗，犧牲了那麼多的人，最後的結果居然只是換了個主子。菲律賓依舊是那些白種人的，自己依舊是奴隸。雖然那些菲律賓人多半沒有學過英語，也不會那句逼格滿滿的“不自由毋寧死”，但是，到了這一步，也絕沒有再老老實實的回去做奴隸的道理了。於是，不多久，各路起義軍就形成了統一的意見，這個意見非常簡單，那就是：幹他丫挺的！
而就在菲律賓人商量着如何向馬尼拉發起進攻的時候，塔夫脫和麥克阿瑟將軍也正在商議，如何消滅菲律賓人的問題。
“我們的目標就是要讓菲律賓人造反。在經過了和和西班牙人的長期的戰鬥之後，菲律賓人中的那些能力更強，性格更堅定的人已經死了不少了。而那些沒死的，也都已經展露頭角了。這些人有能力，有野心，只要他們還存在，美國就不可能安安穩穩的統治菲律賓。即使我們現在和他們達成妥協，那也不過是在未來埋下隱患。所以，藉着這個機會消滅他們，對於美國將來在菲律賓的統治是非常有利的。因爲任何一個民族，至少在相當長的一段時間之內，像這樣的人，數量都是有限的。所以，消滅了他們之後，至少幾代人之內，菲律賓人就不可能再起來反抗我們的統治了。而菲律賓是一個羣島，到處都是茂密的原始叢林。這會使得我們要清剿那些菲律賓人變得非常的困難。西班牙人也就是因此始終無法徹底的消滅那些抵抗者。因爲一旦戰敗了，他們就會逃入叢林，然後在裡面舔好了傷口，又出來搗亂。所以，將軍，對於這種狀況，你有什麼想法沒有？”塔夫脫總督正在對麥克阿瑟將軍這樣說。
“總督先生，這些人現在正集中在馬尼拉附近。不過，老實說，我手裡有擊敗他們的力量，但是缺乏殲滅他們的力量。就像您說的，他們很容易就會逃進叢林裡去。我的戰士在任何時候，都已以一當十，但是我們的人數太少，不足以阻止他們逃跑。所以，總督先生，我有這樣的一個想法。菲律賓人對於我們的戰鬥力其實並不是非常的清楚。雖然他們在前一段時間和我們是友軍，但是我們之間的配合作戰是很少的。因爲我們之間的差距太大，根本就配合不起來。無知可以帶來無畏，尤其是在前面還有馬尼拉這樣的一個誘人的目標的時候。所以，我打算這樣做……”
……
美國軍隊和菲律賓起義軍之間劍拔弩張的緊張局面終於被一個小火星點燃了。1898年4月17日，一隊穿着老式的西班牙軍裝的菲律賓士兵出現在了菲律賓起義軍的一處軍營前。宣稱他們奉命前來收繳借給菲律賓起義軍的武器。
起義軍的戰士們認出了這些穿着西班牙軍裝的菲律賓人是些什麼人。他們都是當初西班牙人還統治着菲律賓的時候，拉起來的所謂的“治安部隊”，所得更明白些，就是菲律賓皇協軍。當初他們跟着西班牙人的時候，看着西班牙人似乎已經要勝利了（在美國參戰前，西班牙人已經把菲律賓大部分的起義軍都鎮壓下去了），於是就肆無忌憚起來，幹起壞事來比西班牙人還沒有底線。（自古以來，賣國賊之類的東西比鬼子還壞就是一個全世.界.通行的傳統了。）所以，當美國參戰後，形勢一逆轉，這幫子菲奸立馬就傻了眼。他們也知道，要是真的讓那些起義者上了臺當了權，他們一個個都得死無葬身之地。好在上帝保佑，美國人並沒有允許菲律賓獨立，甚至也沒有解散他們，而是繼續保持着他們的建制，甚至還給他們更換了一部分武器，讓他們繼續負責維護治安。
這一天，馬尼拉治安軍的小頭頭加西亞接到了美國人的命令，美國人命令他們拿起武器，到城外去收繳那些造反的菲律賓人的武器。加西亞知道，這絕對是個作死的任務，也許美國人就是希望……但是他也明白，如果抗命，只會死得更快。於是他只好帶上人去做這個送死的任務了。
果然，在表明來意，並要求菲律賓起義軍交出武器之後，戰鬥就爆發了。早有準備，並且一直躲在後面的加西亞立刻撒腿就跑。而起義軍在後面追趕着就朝着馬尼拉過來了。
負責防禦馬尼拉的美軍向菲律賓人開槍示警，不過這並沒能讓菲律賓人停下來，他們繼續向着馬尼拉市區前進。而美國人的阻攔也不算堅決有力，結果，菲律賓起義軍很輕鬆的就衝進了市區只是在快到核心地區的時候，才漸漸感到了一些阻力，美國人似乎到這個時候才漸漸的而反應了過來，用機槍，直瞄火炮，迫擊炮和定向雷構成了一道看起來其實也算不上有多堅固的防線。菲律賓人甚至感覺到，只要他們再稍微加把勁，也許他們就能直接把馬尼拉城給攻下來了。
原本這些菲律賓人對美軍還有點害怕，但是如今看來，美軍好像也就是那麼回事而已。再加上前面已經打得火熱了，套用美國人的一句話就是“從北邊吹來的大風已經清楚的帶來了武器的鏗鏘聲，我們的同胞已經身在戰場了，難道我們還要修手旁觀嗎”。而且更重要的是，前面的戰鬥似乎非常順利，也許只要再努力一把，獨立建國的夢想就能實現了。於是包括阿奎納多在內的菲律賓領袖們都作出了繼續增兵，加強進攻的決定。