一處公寓走廊內，詭異的一幕正在此處上演。
三柄“矩陣沙鷹”的槍口火舌吞吐，一顆顆子彈拖着一條條的氣浪軌跡射向“死而復生”的尼奧——如果擊中，尼奧必成馬蜂窩。
但是尼奧卻似乎全不將那些子彈放在心上似的，就在那裡站着不動。
此刻的尼奧，已經和之前大不一樣。彷彿一個抄經十載驟然頓悟的僧人一般，雙眼飄忽但是一點也不迷茫，相反彷彿在以一種全新的視野去洞察全新的世界。
尼奧單手前探，那些呼嘯而來的子彈竟越來越慢，越來越慢，最後定格在了他的面前。時間彷彿在這一刻停止。尼奧眼中閃過一絲疑惑，不由得拈下一顆子彈。事實上就連他自己也弄不明白自己爲什麼會這樣做，又爲什麼能夠讓子彈停下來。就彷彿，耳畔有一個聲音在說：我能夠這樣做，我應該這樣做，我在這裡無所不能！
下一刻，所有定格在空中的子彈一齊墜落。
三個“矩陣特工”面面相覷。史密斯憤怒的怪叫一聲，將手中的槍一丟，化作一條黑影就衝到尼奧面前，一雙拳頭如雨打飄萍一般擊出，收發拳的速度快到只能看到一團黑影，根本看不清楚史密斯的手臂。換做一般人來只怕早被全身打爛了，但尼奧卻從容不迫的舞動着手臂，雙足立地如生根，將史密斯全部的拳頭的攔截了下來。幾個呼吸後，臉帶尼奧的尼奧竟然側過身子，看都不看史密斯，竟然單手就將史密斯全部的攻擊都封住了。
“砰砰砰”撞擊聲充斥着這條狹窄的走廊。
只因爲，此刻史密斯的動作在尼奧眼睛中卻是非常非常的緩慢。
直到這一刻，他才真正的相信，自己就是“救世主”——只是他並不知道，只不過是先知賦予它的“救世主程序”被必要的條件激活了罷了！
“救世主程序”由何而來？先知給予他的那塊餅乾！
必要的激活條件是什麼？崔尼蒂的“真愛”！
聽起來或許很玄乎，但是這一切都是“先知”一手主導的。她在經歷了前五代“救世主”的抉擇之後，發現一開始賦予“救世主”悲天憫人的慈悲心博愛心並沒能打破“母體”與“錫安”之間的宿命輪迴般的循環。“母體”始終沒有臻於完美真實，而人類卻也一代又一代的飽受悲慘的命運，於是她想要改變。一開始並不賦予“救世主”公情，相反給予他私情也就是男女之愛，看看最後會有怎樣的結果。可以說，“先知”自己同樣在冒險！
且說，尼奧單手就接下來了史密斯狂風暴雨般大的進攻，很快便覺得沒意思了，當即一腳飛踢出去。
史密斯就好像斷了線的風箏一般飛出去，跌趴在了地上。
“尋常的手段殺不死他們，只能從內部刪除他們的代碼，先用那個史密斯試一試！”尼奧腦海中閃過一個念頭，就如同一直利箭飛射過去，史密斯根本來不及反應，就給尼奧鑽入了體內。乍一下史密斯還反應不過來，不過很快他就感覺到了體內的異樣。
他在清除我的源代碼！
隨着史密斯身子一陣扭動，一道道裂紋開始出現在他的體表，白色的光芒刺出。
砰！
史密斯的身子整個從體內爆炸開來，瞬間化作虛無。而尼奧卻安然無恙的站着。
瓊斯還有布朗兩個人看了，對望一樣就立即跑路。顯然就算他們是殺毒程序，也懂得什麼叫做恐懼和怕死。
尼奧並沒有去追，而是跑向那依舊發出跳躍般鈴聲的電話。他有種感覺，某種不好的事情發生了……
……
尼奧猛的睜開眼睛，剛要動動身子，卻發現自己的身體被綁了起來，手腳完全動彈不得——這是給一個剛剛凱旋歸來的勇士的待遇嗎？
“尼奧！”崔尼蒂的聲音響了起來。
尼奧問道：“發生了什麼事情？”
“她們佔領了船，控制了塞弗，還……還殺了賽文坦克他們……連墨菲斯也被他們囚禁起來了。”崔尼蒂被再次給綁回了躺椅上。“深層覺醒”的她就算在現實世界也實力不俗，但是奈何手腳被廢，對方又有槍，又控制了尼奧和墨菲斯的生死，就算反抗也是多餘的。
“這究竟……爲什麼！？”尼奧用力的掙扎着身子，只可惜雖然他現在在“母體世界”中是一個超人，可是在眼前的世界，剛剛“完全覺醒”的他本體的力量卻着實不大，興許補充到豐富的營養之後力量會增強也不一定——畢竟在第二部可是連預知未來的能力都擁有了，第三部更是擡手間毀滅一大羣的機械兵。
所以任憑尼奧如何掙扎，頭部以下的身子根本就動不了。爲了保險起見，樑幼蔓可是將他綁成了大糉子，同時爲了預防他的念力異能椅子上還連接了電流，通電按鈕就控制在樑幼蔓手中。
樑幼蔓笑道：“拯救世界。這些都是必要的犧牲。這不正是你們一直想做而做不到的嗎？”
和崔尼蒂一樣，尼奧無話可說。又是劫持戰艦又是殺人，最後你說“拯救世界”，你讓人還怎麼說？
“你們想要什麼？”尼奧強忍着心頭的痛苦和悲傷，當然更多的是憤怒。他知道對方這樣做，又沒有直接殺他，必定是有所企圖的。只要自己有對方想要的東西，那麼就有談判的基礎。
樑幼蔓道：“這個還用問嗎？我們要拯救世界，自然需要你‘救世主’的力量咯。現在你就是‘救世主’，我想你該不會不承認吧？”尼奧深吸一口氣讓自己更加冷靜，“你們究竟是什麼人？”
樑幼蔓道：“問這些就是多餘的了。你只需要清楚我們要幹什麼就行。”老實說，在自己佔盡優勢的情況下，樑幼蔓很厭敵人沒完沒了的問一堆“你們是什麼人”“你們要幹什麼”這類簡直白癡到極點的問題。又不是勢均力敵，要坐下來脣槍舌劍的談判一番。
這個時候，塞弗突然急切的叫道：“墨菲斯就要脫困了，他的意志力太強了。”樑幼蔓一驚，道：“你再堅持一會兒。”雖然墨菲斯也被綁住了，應該脫不了身，可是樑幼蔓就怕墨菲斯到時候會幹出“捨生取義”之類的事情來，那往後的計劃都要崩盤！敲暈又不行，大腦不活躍根本無法送入“母體世界”之中。
樑幼蔓迅速撥通辛途的電話，可是隻聽到“嘟嘟嘟”的聲音，電話的另外一頭根本就無人接聽。
“那邊的‘出口’還保持着開啓嗎？”
“是，是的！而且，陸的訊號又一次的消失了。”塞弗急的滿頭大汗。當然不是爲辛途着急，還是爲他自己。他算是看出來了，這羣人就是一羣瘋子。艾博和斯薇琪已經死了，不用想也知道那個陸乾的。
“怎麼又出故障了……”樑幼蔓也不耐煩了起來。
辛途的計劃在她看來是完美無缺的，整體來說直到現在也實施的很順暢，可是奈何變故和意外實在是太多了。先是被塞拉夫盯上，現在又不接電話，不知道又出了什麼突發事情。這個時候羅娜說道：“樑姐，還是讓我進去看看吧。”
“……好。”
很快，羅娜也接入了“母體”之中，就出現在辛途所在的位置。
羅娜一閉眼，在一睜眼，就發現自己已經來到了一處廢舊的寫字樓的某一層。這是她第一次離開“母體”後再返回“母體”，自然倍感新奇，可是不等她過多的查看周圍，就聽到一聲大叫聲。
“滾！從我體內滾出去！”
一個“滾”字，充斥着憤怒與焦急。
羅娜扭頭望去，就看到一個人從廢棄的辦公桌下爬了起來，然後又撞倒辦公桌倒了下去，發出一陣乒乒乓乓的響聲。
不是陸先生是誰？
辛途的確是又遇上意外了。
就在他耐心的等待着訊息的時候，突然他感覺到體內一陣膨脹收縮甚至扭曲的感覺，根本不知道發生了什麼。直到一個微笑的聲音響起來在腦海中，“密斯特陸，你知道我是誰嗎？”
“史密斯！？”辛途大驚，“你怎麼會在我的體內？”
“我一直與你在一起，”史密斯一邊入侵辛途的精神體一邊道，“還記得那顆綠色藥丸嗎？裡面有一段我自己的代碼。我的源程序被密斯特安德森刪除了，但是我卻得到一些有趣的東西，‘救世主’的代碼。真是幸運！但是重新編寫身體的代碼並將‘救世主’的代碼插入其中實在是太麻煩了，需要很多時間，可是我等不及，所以我就想到了你。利用你精神內的我一段源代碼，我可以省去很多的功夫。”
史密斯這個混蛋竟然想要佔據我的身體獲得重生？！
這下子辛途終於急了。
他當然一千一萬個不願意，所以他開始反抗……但是他卻發現他根本不知道怎麼去反抗，意志力驅逐？這根本已經超脫於意志力影響範圍了。史密斯已經獲得了“救世主”代碼，正在向“滅世者”升級，除非尼奧……可是一旦尼奧進來，他的計劃將徹底崩盤，等待着他的結局依舊是死亡！
所以，他只能一點點的看着自己的腿部開始變成一雙穿着黑色西褲配和黑皮鞋的腿，這顯然不是他自己的！
然後，他的手也開始變爲史密斯的手，且不受自己控制，一點點的，變化的區域開始向上蔓延。
可就在辛途幾乎要絕望的時候，腦海中突然電光一閃，“那塊餅乾！沒錯！那塊餅乾就是剋制史密斯的，那個先知一定早就預見了這一幕！”
正好在這個時候，他看到了羅娜，那個樑幼蔓的隨從，當即就喝道，“快，過來！”
羅娜立即跑過去，不等她開口就聽辛途焦急的喊：“搜我的口袋，快，餅乾拿出來我吃。快啊！”
反正不吃也是死，不如吃下去試試！