穩定了謝傑的傷勢的同時，袁福通對於這些年流雲宗上下發生的事情，也有了一個大概的瞭解，雖然這些事情真沒有多少讓袁福通心情舒暢的。
在袁福通最開始離開的那一段時間，流雲宗的處境還是比較安穩的。雖然裂魂魔皇很想直接解決流雲宗，但因爲袁福通不知所蹤，最終裂魂魔皇還是沒有下手。畢竟袁福通的潛力誰也說不清楚，即使他自毀了仙種也是一樣。
而且從袁福通敢自毀仙種這件事上，裂魂魔皇清晰的感覺到了袁福通的狠絕。如果袁福通肯定始終停留在還虛階，裂魂魔皇還可以無視袁福通的威脅，但袁福通只要還有進階煉虛的希望，裂魂魔皇就不敢真的對流雲宗動手。因爲一旦動手，就意味着和袁福通不死不休。萬一袁福通真的進階煉虛，整個真魂魔域都會面臨無法承受的損失。
裂魂魔皇放棄了對流雲宗的打算，雖然有些勢力想要對流雲宗下手，但有朱元宮和天狼山或明或暗的爲流雲宗保駕，流雲宗並沒有受到什麼大的衝擊。不過因爲袁福通消失和其他幾家勢力的隱隱壓迫，流雲宗聯盟外圍的一些勢力開始渙散。
對於這種情況，謝傑等人並沒有什麼辦法，也只能盡力用平和的手段挽回。實在不行的，也只能聽之任之了。而在這二百年中，流雲宗聯盟的整體實力在這種漸變式的削弱中下降了將近三分之一，內部的凝聚力也下降了不少。不過這些年中流雲宗根基沒有動搖，內部也培養了一些核心弟子，所以情況還算能夠接受。
不過在袁福通離開一百多年之後，人族和妖族之間的矛盾開始變得明顯起來。雖然兩族內不希望爭端擴大的勢力都作出了努力，但因爲沒有了袁福通這個身份特殊的人物居中調節，情況在有心人的挑撥之下，惡化的相當快。而在接近二百年的時候，人族散修和蛇族的一次大沖突將危機引爆，多方調解無效的情況下，人妖兩族明顯對立了起來。而這種情況下，本身就打着調和人妖兩族矛盾旗幟的流雲宗自然處境尷尬，而無論是朱元宮，還是天狼山，都不能再明着庇護流雲宗了。
沒有了這兩家的庇護，流雲宗的危機開始顯現。本來那些只能偷偷『摸』『摸』行事的勢力開始變的明目張膽，加上聯盟內部本身就有一些心懷不滿的人，所以謝傑等人很快就控制不住形勢，聯盟將近一半的力量分崩離析。好在這個時候以雲華宗爲首的從鴻蒙域遷徙過來的力量大部分堅定的站在了流雲宗本宗一方，穩固了形勢，沒有讓聯盟徹底瓦解。
不過針對流雲宗的攻擊並沒有因爲流雲宗勢力大減而消退，反而變得有些變本加厲。雖然沒有還虛後期的高手明着出面，但原本和流雲宗並不怎麼搭界的散修高手開始陸續和流雲宗作對。發展到最後，居然出現了幾個還虛階散修高手聯合，衝擊流雲宗的局面。雖然他們打着的旗號是搶奪袁福通留在流雲宗內的修煉秘法，但誰都感覺的出來，這是針對流雲宗的陰謀。也正是爲了抵擋那一次有計劃的衝擊，謝傑等流雲宗聯盟的高手全部負傷。好在謝傑等人的英勇戰鬥也重創了敵人，給了流雲宗爭取了一段時間。而在這一段時間裡，安豐出關，震懾了那些野心勃勃的勢力，讓流雲宗存活了下來。當然，因爲安豐的特殊身份，依然有人不想繼續留在流雲宗內，這些人也都陸續離開了。不過相比最開始的時候，情況要好很多。
回顧整個過程，流雲宗在那一段混『亂』的階段裡，其實是相當危險的。之所以沒有陷落，一方面固然是因爲謝傑等人的死戰，但更爲重要的原因，恐怕是背後黑手的猶豫和安豐的提前出關。被估計要五百年左右才能完成這次煉化的安豐，只是用了二百多年就將青羊界煉化，成爲了煉虛階中有着絕對優勢的高手。這種情況下，幕後黑手即使再蠢，也不敢再對流雲宗下手了。
弄清楚了這些之後，袁福通並沒有馬上衝動的去找月皇宗的麻煩。一方面來說，袁福通雖然信任謝傑不會欺騙自己，但並不是很相信謝傑的情報能力。這件事情關係重大，而且非常嚴肅。如果因爲情報不準，找錯了報復對象，不僅會對流雲宗甚至人修修士整體不利，而且會讓幕後黑手看笑話。所以在處理的時候，袁福通需要慎重一些，並且需要一些其他的情報輔助。
而另一個讓袁福通不敢放手施爲的原因，是流雲宗現在的安全問題。雖然隨着袁福通的迴歸，並且進階煉虛階，從理論上來講，流雲宗應該已經安全了。沒有人會輕易對煉虛階修士庇護的宗門發動進攻，除非他們有把握幹掉這個煉虛階修士。
但是在看到流雲宗這些年的經歷，想到自己得罪的雲魂族等異族之後，袁福通並不敢完全放心下來。在毀掉了暮霞珠之後，袁福通已經可以算作雲魂族的死敵了，難保對方不在激憤的情況下做出什麼出格的行動。而且就算雲魂族不衝動，在聖妖殿聯盟準備真正動手，當他們準備和人族修士撕破臉皮，或者有把握解決掉袁福通的時候，依然會對流雲宗下手。一旦陷入這種情況，以現在流雲宗的情況是絕對支撐不下去的。那個時候，就算袁福通能夠在戰鬥中獲勝，也改變不了流雲宗覆滅的結局，這是袁福通絕對不願意看到的。
認識到了這些之後，袁福通接下來的工作就很明確了。給狼神，安豐，華朱道人等人發出訊息，詢問當年幕後之人的同時，袁福通將精力都投入到了改造流雲宗上。
改造流雲宗的第一步，自然是宣佈迴歸和進階的消息。袁福通在流雲宗內的威望，是無人可以匹敵的，之前流雲宗絕大部分的聲望，都是袁福通撐起來的。這些年出現各種變故，主要原因也是袁福通下落不明，各種謠言動搖了流雲宗內的人心。眼下袁福通強勢迴歸，並且帶來了進階煉虛這種超級震撼的消息，流雲宗上下的士氣一下子就提升到了頂點。
事實上，這些年流雲宗聯盟的勢力雖然可以說四分五裂，分崩離析，但對於流雲宗來說也未必完全是壞處。正所謂疾風識勁草，板『蕩』知忠臣，經歷了一次次的大風浪之後，能夠依然留下來忠於流雲宗的，對流雲宗的認可程度都是極高的。意志和忠誠不足的人，早就自行離開了。眼下這些人實力不突出，所以看起來流雲宗很落魄。但如果這樣一批可以成爲核心弟子的人成長起來，那麼流雲宗的未來絕對是驚人的。
提振起宗門弟子的士氣之後，袁福通根據謝傑提供的資料，對整個流雲宗聯盟進行了一次極爲徹底的改革。在徵詢了蝶雲等人的意見後，袁福通以相當高的自主權爲條件，將原本只能算是流雲宗盟友的雲華宗等勢力正式納入了流雲宗內，組成了新的流雲宗本宗。
事實上，經歷了生死的考驗之後，寥寥幾個盟友已經和流雲宗徹底綁在了一起，已經沒有再分彼此的必要，合併不合並區別並不大。有獨立傳承的權利，有袁福通這個煉虛階的領袖，雲華宗衆人也願意加入註定要強大起來的流雲宗。
這樣一來，原本的流雲宗聯盟都成爲了流雲宗的本宗，流雲宗的根基壯大了很多。當然，流雲宗聯盟的制度並沒有廢除，而且有了更爲嚴密的制度。因爲在袁福通進階煉虛的消息傳出之後，歸附的勢力絕對不會少，可以想象，流雲宗聯盟將會在袁福通願意的時候，迅速膨脹。不過那些後來加入的勢力，不可能享受流雲宗本宗的待遇，他們必須給流雲宗本宗上繳足夠的供奉，而這一點，也是袁福通未來對這些年堅守流雲宗修士的一種獎勵和補償。
處理了宗門的組織問題之後，袁福通開始爲負傷的幾位煉虛階修士療傷。雖然因爲剛剛進階煉虛不久，袁福通並沒有什麼豐厚的身家，也沒什麼頂級的療傷丹『藥』，但袁福通擁有的火焰力量可以煉化近乎所有的異種力量，依靠這種力量驅逐糾結於修士體內的異種力量是非常輕鬆的。而驅逐了異種力量，只是恢復的話，對還虛修士還是很簡單的。
在爲幾人療傷的同時，袁福通對於極爲還虛階修士的修煉也作出了指點。因爲療傷的時候全面瞭解了修士的情況，所以袁福通的指點都很有針對『性』。而從雲魂族凝魂真典中總結出來東西也被袁福通拿了出來，供幾人參考，作爲幾人護衛流雲宗的獎勵。這些東西短時間內還沒有什麼太明顯的作用，但過上一段時間，就將會對幾人產生巨大的影響。特別是蝶雲，謝傑等人，進階還虛後期的可能提高了很多。而嫡系人馬進階還虛後期，也是袁福通很希望看到的。
做完了這些之後，袁福通開始做最爲重要，也是最爲瘋狂的一件事，那就是把整個流雲宗煉化入自己的萬象虛空，也就是火玉仙種內。