明洪武十九年設吳淞江守禦千戶所，修築吳淞城塞，嘉靖年間設吳淞總兵，專事防倭事宜。名將俞大猷多次在吳淞擊破倭寇的襲擾。
經過兩百多年的修築展，現在的吳淞城周長四里，城高兩丈五尺，護城河水寬五丈深一丈，和吳淞江相連。城池距離長江三裡，設有四座城門，雉堞119o個，敵臺九處，有水門直通吳淞江。
堅固的城池以及停留在吳淞江的數百艘戰船，是大明能夠控制長江、阻止倭寇內侵的根本。
然而南京失陷，弘光被擒之後，防守吳淞的總兵吳志葵雖然不願降清，卻也不願抵抗清委任的吳淞總兵李成棟部，而是帶着部分手下以及全部的戰船離開了吳淞，退入了松江府西部的柳湖一帶。
李成棟輕易的接收了吳淞城，可是因爲隸屬於吳淞的明軍水師戰船大部被吳志葵帶走，現在李成棟手中只有百餘艘小號的江船，使得他攻略崇明的使命無法進行。在被派到吳淞之前，爲了能夠打下崇明島，多鐸給李成棟加強了兵備，在他直系三千多精銳的基礎上又劃撥了數部綠營兵給他，使得現在李成棟屬下兵力達到了一萬有餘。
可是隻有兵也不行啊，沒有戰船就無法攻上崇明島，所以到達吳淞城十多日來，李成棟一邊整修城防，一邊派人去聯絡吳志葵，試圖招降與他。誰知吳志葵對李成棟的招降全無反應，據說帶着水軍往蘇州方向去了。
潤六月十日，松江府爆了反抗大清的舉事，松江百姓在沈猶龍陳子龍等人的帶領下驅逐滿清委任的知府，佔據了松江府城。
消息傳到吳淞之後，李成棟卻沒法出兵平叛，因爲沒有水師，他屬下的軍隊無法渡過黃浦江。而且嘉定的叛亂更在松江之前，李成棟之前留在嘉定城東的一百艘戰船（因爲水位太淺的原因，無法駛入吳淞江），被嘉定的亂民燒掉了，三百留在嘉定的部下被殺。
嘉定距離吳淞只有七十多裡，亂民的暴動直接影響到吳淞的補給。李成棟知道，自己必須出兵了。遂留下副將李仁芝守城，帶着弟弟李成良義子李元胤並八千精兵出城，往嘉定而去。然而行走在半路，接到了張天福的求援信使，得知崇明出兵攻打太倉州的消息。
對李成棟來說，松江嘉定亂民的暴亂不足爲懼，只要大兵一到即可輕鬆撲滅。唯有崇明軍乃是心腹大患，在揚州時，對於崇明軍的堅韌李成棟知之甚深。不過李成棟也知道，經過揚州之戰，任思齊手下的軍隊同樣損失過半，現在崇明的精銳士兵也就數千人。
其實在李成棟心裡，對任思齊並不服氣，任思齊當初之所以能守住揚州，靠的也就是城高濠深，又有水軍控制着運河。若是兩軍對陣，李成棟自信僅憑自己一軍，就可以擊潰崇明軍。
李成棟的部下乃是興平伯高傑的老底，有精銳騎兵一千五百人，隨着高傑征戰多年戰力不俗。除了不敢和滿人八旗兵對陣以外，對於其他的綠營兵以及殘餘的明軍，李成棟並不放在眼裡。
所以當知道崇明軍攻打太倉的消息之後，李成棟立刻改向太倉進軍，途徑羅店鎮，擊潰聚集在羅店的千餘義民，入鎮洗劫了一番，殺死鎮中百姓兩千多人，繼續向西而去。
......
崇明島，崇明新城，任思齊已經得到了李成棟出兵的消息。
“出兵吧，攻下吳淞城，截斷李成棟的退路！”
隨着任思齊的命令，第一鎮的士兵連同茅十八的水軍全軍出動，往長江南岸而去。
二十多艘三桅帆船打頭，駛入了吳淞江，百炮齊，清軍的百餘艘小船稍作抵抗就被打的落花流水。
在火炮的支援下，第一鎮的步兵輕鬆踏上了吳淞江的西岸，往吳淞城攻去。
吳淞城距離長江三裡多，城頭也有十餘門火炮，可是與崇明軍的火炮相比，不免太弱。三裡多的距離，卻在岱山軍的大炮射程之內。三桅帆船上的紅夷大炮數量衆多，其中“公主號”、“飛魚號”上更是有數十門繳獲自荷蘭人的加農炮，射程在四五里左右。
明軍艦船在長江中一字排開，向吳淞城展開了炮擊。此時的吳淞，沿江之處並沒有設立炮臺，主要是設立吳淞城時，主要是爲了防倭，而倭寇的船隻炮火遠遜與明軍，所以當初並沒有想到吳淞有一日會遇到來自江上的炮擊。而此時清軍又沒有水師，雖然吳淞城塞堅固，可對於明軍來說幾乎就是不設防的。
幾十門大炮輪流開火，炮彈連綿不絕的砸向吳淞城中。
雉堞破碎，垛口裂開，城上的清軍被轟擊的人仰馬翻、慘叫連連。
其實那個時候的火炮都是實心炮彈，任思齊有心開空心彈，可是一直沒有研製出來。
而明軍的炮火雖然猛烈，其實對城中的清軍威脅並不是很大。可是隻能捱打不能還手的滋味實在不好受，加上城內的清軍大部分被李成棟帶走，現在吳淞城內剩餘的兩千人都是戰力一般的士兵。
所以在崇明軍的炮火攻擊下，城內的清軍很快頂不住了。半日之後，城內清軍在副將李仁芝的帶領下退出了吳淞城，往西追趕李成棟而去。
任思齊親自帶領軍隊進入吳淞城中，崇明軍的戰船分佈在吳淞江和長江之中，有了吳淞城在手，就有了在大陸的立足點，以後松江蘇州各地的物質將可以源源不斷的進入崇明。
拿下了吳淞還不算完，任思齊接下的打算就是剿滅李成棟這支漢奸軍。
歷史上的嘉定三屠，死在嘉定的百姓數萬，都是死在李成棟的部下，鎮壓了嘉定之後，李成棟又回師松江，滅了松江府城的沈猶龍義軍，攻滅了吳志葵水師，最後又攻破了金山衛城。可以說江南反抗滿清的舉義，有接近一半都是李成棟撲滅，其中死在李成棟手下的百姓不下十萬。雖然說李成棟後來率兵反正，也只是不滿清朝給他的待遇，並不是真的心向大明。
這一世，嘉定三屠還未生，對於李成棟這樣的劊子手，任思齊絕對不會容忍，早在崇明出兵之前，他就下定了剿滅李成棟的決心。
佔據了吳淞之後，任思齊稍作安排，命令晉玉飛帶領三千人鎮守吳淞城，他自己則親自帶領兩營老兵出城，往嘉定方向而去。