到了襄陽之後，直接到了郭府，此時的襄陽已經被那元蒙軍隊圍困，而黃蓉也臨近待產，郭靖正焦頭爛額，見到孔錚也是十分欣喜。此次襄陽保衛戰，全真這第一大派卻是沒有一個人到來，也當真是諷刺。
“孔師弟，你這修爲突破了？”郭靖發現自己看不透孔錚了。
“郭師兄，師弟僥倖突破，不知城內可有我全真弟子到來助戰？”
“呃，全真弟子尚且沒有，聽說蒙古大軍已經將終南山到襄陽的路給斷了。”郭靖對全真的所作所爲也有些不滿。
“唉，師門衆人糊塗啊，國將不國，守着那個破山頭還有什麼用。”
“孔師弟慎言，丘道長他們可能有別的安排吧。”
“全真已經不是重陽祖師在時的全真了，那股血性已經不見了，襄陽事了之後，我就回去一趟。黃師嫂什麼時間生產，到時我幫忙護衛，防止奸詐小人拿孩子說事。”孔錚也不管了，他不想讓人拿着郭襄搞事情，管他是楊過還是金輪法王亦或是赤練仙子，現今的他有這個實力。
“多謝孔師弟，蓉兒她預計是在七日後生產。”
“那好，麻煩郭師兄給我在黃師嫂周圍安排一個屋子，我在那裡守着就好了。郭師兄放心處理守城事宜，有我在一天，師嫂和孩子就不會出事。”
於是，孔錚就住在了黃蓉附近，大家都是江湖兒女，沒有那麼多避諱的事情。更何況孔錚現在的身份是全真教的道士，那可是沒有婚嫁的，呃，馬鈺和孫不二除外。
神鵰第一精明女人黃蓉和目前戰力第一人成了鄰居，孔錚每天就是閉門修煉先天功，王重陽不愧是先天第一人，這功法玄妙無比，將自身修成無漏之體，如果不是舊疾復發加上對林朝英的思念，他也不會英年早逝。
孔錚目前先天功達到小成境界，自身修爲也到了先天后期，無漏之體也有了小成，結合九陰真經鍛體功法，後天境界使用的普通刀劍已經傷不到孔錚的肉身。只有同爲先天之人使用刀劍才能將他傷到，這也是他敢於對郭靖保證的主要原因。
在等待黃蓉生產期間，郭靖出城救了流民，楊過思忖再三也出手了，將敵人擊退。孔錚知道此時的楊過已經陷入魔障，爲了救小龍女他可是什麼事情都敢幹，更何況他認定郭靖黃蓉就是那殺父仇人。
“楊少俠，留步，貧道有幾句話對你講。”
在郭靖黃蓉誇獎楊過之後，孔錚找個地方單獨與楊過見面。
“楊少俠，我之前去過那絕情谷，大敗那公孫止，也知道了絕情谷有那情花奇物。本人也初通藥理，毒物三丈之內必有解藥，還望楊少俠慈悲爲懷，不要走了歧路。”
話都說道這份上了，楊過聽不聽是他的事情，他只是這階段的天命之子而已，沒見郭靖那上任天命之子，最終都力竭被圍殺在襄陽。
“我將守護在郭夫人身邊，任何想要從她和孩子身上打主意的人，我都不會客氣的。”
說完之後，孔錚就離開了。
七日一晃而過，郭襄和郭破虜按時降生，各路牛鬼蛇神也都出來了，李莫愁、楊過、金輪法王、霍都、達爾巴都出來了，孔錚獨孤九劍劍氣四射，連斬霍都和達爾巴，重傷金輪法王和李莫愁，放了楊過，同時殺了數百入侵的其他武林人士，襄陽郭府血流成河。
“我今天放話在這裡，有誰再對這兩個孩子動手，別怪我去滅你滿門，無論是江湖豪門還是朝堂貴胄。”孔錚浩浩蕩蕩的聲音傳遍整個襄陽城。
總有人不服氣，幾個投靠元蒙的幫派派幫內高手再次偷襲郭府，孔錚抱着兩個嬰兒蒞臨，將之覆滅，派內上下幾千人被殺，當真是雞犬不留，“滅門道士”的稱號也隨之傳遍整個江湖，郭襄和郭破虜名聲隨之傳遍天下。
襄陽事了，孔錚就跟郭靖和黃蓉道別，他準備回終南山了。
“郭師兄，我說過的話依舊有效，兩個孩子你們保護好，如果有誰再來搶孩子，給我傳信就好，我必將這江湖朝堂殺個天翻地覆。”
“多謝孔師弟。”黃蓉是最高興的人，相對糾結的郭靖，她的正邪之分沒有那麼明顯，自家孩子有了保護傘當然開心。
隨着孔錚的殺戮，不論是元蒙還是大宋，大家都消了對着兩個孩子的念頭。而楊過和小龍女也回到了古墓準備了卻餘生，楊過還是沒有把孔錚的話聽進去，解藥沒有找到。
回到全真，孔錚跟全真七子也攤牌了，建議門派南遷，但並沒有通過。七個老道士非得守着自家基業，哪怕死也要守着。孔錚無奈只能選擇閉關衝擊先天功大成和先天巔峰。
待得孔錚一年後出關時，命運齒輪成功修復，楊過成了神鵰大俠，小龍女消失無蹤，不禁讓人有種無力感。唯一不同的是，由於孔錚的存在，全真尚未被滅。但是門內也劃分了多個派系，全真七子老了，年輕人們有了自己的想法，許多人就出生在北地，對南宋朝廷沒有任何情感，投靠了元蒙，還有一部分就是想要自立門戶，爲數不多的以尹志平爲首想要匡扶南宋朝堂。
孔錚見了全真內況之後，也有些心灰意冷，這全真不滅都對不起他們。與郝大通聊了一宿之後，孔錚就離開全真了，此時郝大通也有了離開的念頭，他對這全真也心灰意冷了。
孔錚離開之後，郝大通帶着幾個弟子悄悄離開了終南山，到了華山潛修。王處一在徒弟趙志敬叛逃之後就已經油盡燈枯，日子也不久了。全真教的掌教在幾年前就傳給了丘處機，但很明顯丘處機不是一個好掌門，見狀又傳給了自家弟子尹志平，全真七子除了郝大通外的其他人閉關潛修。
一年之後，教內元蒙一派將孔錚和郝大通一脈離開的消息傳給元蒙，金輪法王帶隊圍困終南山，在其他人沒來得及馳援時，全真內戰徹底分裂，尹志平一系全部覆滅，也是應了當年的因果。活下來的元蒙一系怕孔錚報復，直接投靠元蒙，丟下破破爛爛的全真，自此，全真被滅獨留華山太古一脈。
讓人奇怪的是，全真被滅時，全真七子的其他人依舊在禁地閉關不出，似乎對門派存亡毫不關心。消息傳遍江湖，引起一片譁然，正在與神鵰大俠喝酒的孔錚聽了之後，笑着對楊過說了一句：“早就該滅了，不得道，又妄爲，武不是武，道不是道，貪癡慎佔全了，何有長存一說。”