我軍的強打猛攻給國民黨的守軍以極大的殺傷，爲了保住臺灣島的前沿陣地，爲了給臺灣島留下一個屏障，蔣介石決定不惜一切代價守住金門島。
25日凌晨4點，國民黨海防第二艦隊司令黎玉璽少將受命率艦隊旗艦“太平”號自澎湖基地開往金門島增援。黎玉璽到達金門之前，已令駐守金門島的國民黨海軍進行海上封鎖，敵202號掃雷艦、“南安”艦駛入古寧頭西北島沙水道，炮擊我登陸部隊，而“楚觀”、“聯錚“、“淮安”等艦和“203”號掃雷艇、“15”、“16”號炮艇等則開至大小金門之間，守護大金門的四側後方。
蔣介石在派海軍封鎖海面的同時，於25日凌晨4點30分派胡璉兵團的18軍118師、19軍14師、18師52團和11師的一個團在坦克和炮兵的配合下從料羅灣登陸。當時，解放軍登陸部隊離灘頭陣地已達十多里路，胡璉看到這一情況，下死命令將該兵團主力18軍投入戰鬥，來了個反包圍，又派迂迴部隊佔領瞭解放軍灘頭陣地，切斷解放軍後撤的退，並用炮火將解放軍登陸部隊因潮水退卻而擱淺的船隻全部擊毀。
解放軍244團團長刑永主帶領全團戰友一直頑強戰鬥到25日中午12點，在全團官兵大多犧牲的情況下仍堅守陣地。251團的主力則一直與敵激戰到3點。之後突出重圍，與古寧頭的253團回合。
251團副團長馮紹堂帶領固守林厝的兩個班的戰士，苦戰了整整9個小時，打退了敵人的7次進攻，後來，爲保存實力，主動突圍到古寧頭，與253團會合。我三支登防部隊在敵強我弱的情況下一齊會合至古寧頭與敵激戰。整整一天一夜，我官兵滴水未進、粒米未入，而數倍於我的敵人則仗着人多勢衆、不斷地輪換着包圍解放軍登陸官兵，就這祥，戰鬥一直堅持到25日的黃昏，官兵們借肋於夜幕才又贏得一個有利的作戰時機。至此，解放軍3個團的登陸兵力已損失半數以上，據島上步話機的報告，第244團僅剩700多人，第251團剩下1200多人，第253團剩餘人數較多，但彈藥卻十分缺乏，而國民黨軍隊在黃昏前又投入較多乓力，企圖將解放軍首批登陸部隊全殲於古寧頭，後被解放軍藉助夜幕打退。
整個金門島戰役，10月25日晚至26日天亮前的一夜是決定整個戰鬥成敗的關鍵一夜，關於這一夜的重要性，國民黨第19軍軍長劉雲瀚於1980年1月在臺灣出版的《中外雜誌》上發表了題爲《追述金門之戰》的文章中寫到： 到了10月25日入夜以後，成爲最危險的一夜。因爲我軍經過了整天激戰，所有的控制部隊都投入戰場，除傷亡相當大外，且多感疲勞，……甚至勝負之數還未易言。幸好由於匪軍沒有船隻，無法繼續航渡來援，所以我們能夠平安渡過這最危險的一夜。