在中美洲的貝利茲（belize）的瑪雅遺蹟中發現了水晶骷髏。這個水晶骷髏是個完全以水晶石加工研磨而成的，大小几乎和人類的骷髏相同。至今瑪雅後裔仍然會施咒於透明水晶，小心地帶在身上。而瑪雅人對骷髏是一種神明供物，象徵和神明心意相通。叫人難以想像的製作技術。水晶是一種硬度極高，幾乎無法任意切斷、隨意造形的礦石，但古瑪雅人卻可以輕易地完成如此精巧的水晶製品。在太古時期，究竟是誰教他們這樣的技術？是否來自地球之外，超越人類的存在，教導古代瑪雅人這種奇蹟技術。
根據古印第安人世代流傳着的一個傳說：他們的祖先留下十三個水晶骨頭，和人類的骨頭一般大，下巴可以活動，能說話，能唱歌。據說這些頭骨可以爲人類的起源和死亡提供資料，亦能爲人類解開宇宙生命之謎，當地球文明達到極致之時，他們會重新出現，並揭示人類過去和未來的秘密。
水晶是最堅硬的天然礦物之一，考古學家聲稱以現時的科技製造這些水晶頭骨恐怕也有困難。
科學家懷疑
墨西哥的原居民阿茲臺克人有用石頭、骨頭、木頭等材料雕刻人頭骨的習俗，稱爲“死亡頭”。其中有一些是用水晶雕刻的，形狀誇張、抽象，風格較爲一致，而且一般都很小。比如大英博物館藏有兩個被鑑定爲屬於“古代墨西哥”的小頭骨，小的一個是用滑石雕刻的，大的一個是用水晶雕刻的，高度也不過1。25英寸。兩個都有穿孔，估計是當念珠或護身符用的。巴黎的一家博物館也藏有一個水晶頭骨，大約爲真人頭骨的一半大小，法國專家認爲是阿茲臺克人在14或15世紀時製作的。但是這並不是神秘現象或“新時代宗教”鼓吹者所說的水晶頭骨。他們心目中的水晶頭骨，與真人頭骨差不多大小，風格寫實，維妙維俏，據稱是瑪雅人的聖物，擁有神秘的力量。
神秘傳說
在美洲印第安人中流傳着一個古老傳說：古時候有13個水晶頭骨，能說話，會唱歌。這些水晶頭骨裡隱藏了有關人類起源和死亡的資料，能幫助人類解開宇宙生命之謎。根據傳說，人們必須在2012年12月21日之前找到全部頭骨。那一天是已經循環了5126年的瑪雅曆法的終結。除非13個頭骨聚集在一起並按正確的位置擺放，否則地球將飛離軸心。只有那樣做，頭骨的超自然力量才能挽救地球。
神秘之處
科學家們曾把水晶頭骨和真正的人類頭骨作了比較，發現除了眼部特徵稍稍偏於人類的正常範圍以外，其他參數都與真正的人類頭骨相差無己。我們知道，近代光學產生於十七世紀，而人類準確地認識自己的骨骼結構更是十八世紀解剖學興起以後的事。這個水晶頭顱卻是在非常瞭解人體骨骼構造和光學原理的基礎上雕刻成的，一千多年前的瑪雅人是怎樣掌握這些高深的解剖學和光學知識的呢？
據說水晶頭骨有催眠功能，如果讓一個人緊盯着水晶頭骨的眼睛處，不多時人便會感覺昏昏欲睡，傳說頭骨是瑪雅人爲病人做手術時催眠病人用的。
另外，水晶是世界上硬度最高的材料之一，用銅、鐵或石制工具都無法加工它，而1000多年前的瑪雅人又是使用的什麼工具呢？另外，這種純淨透明的水晶雖然硬度很高，但質地卻脆而易碎，科學家們推斷：要想在數千年前把它製作出來的話，只可能是用極細的沙子和水慢慢地從一塊大水晶石上打磨下來，而且製作者要一天24小時不停地打磨300年，才能完成這樣一件曠世傑作。
令瑪雅人爲之頂禮膜拜的水晶頭骨，後來經科學家鑑定這是從一整塊很大的高張度的水晶石上雕刻，打磨下來的傑出的藝術品。
檢測工作於1970年在美國加利福利亞薩坦科萊羅的海爾萊德一派克爾德水晶實驗室進行。檢測表明，水晶頭骨是由真石英水晶製成，而天然真石英水晶完全是大自然的產物。它生於地下，個別石英水晶的形成過程需要上億年的時間。水晶生長在地殼深處，通常都要經歷火山和地震。在形成過程中凝結了巨大的熱量和力量，然後由“種子“水晶將其釋放出來。種子是由一個單一的硅原子在高溫高壓的作用下，與兩個在高溫狀態下的水分子或周圍的蒸汽中釋放出來的氧原子組合而成。原子組合以後就形成了帶有單一水晶細胞的二氧化硅，所有的石英水晶都是由這種物質組成的，其副產品爲氫。在上千年的漫長歲月中，如果條件允許，這一單一種子就開始生長，但周圍的流體必須含有適量的硅和水或是長期處於高溫高壓下的蒸汽。當原生的流體慢慢地滲人到二氧化硅的第一個細胞上時，這個細胞就開始衍生出另外一個和自己一模一個的細胞，但在複雜的水晶結構中一次只能形成一個原子。水晶體內的每個細胞形態都是重複相同的，每個細胞自身都是一顆小水晶，每個細胞都像前一個細胞一樣有着相同的形態。這樣水晶就搭起一個複雜的三維結構架--“水晶架“，因此而得名，其幾何構成極其規律。就這樣日積月累，漸漸的一塊純淨透明的天然石英水晶就形成了。它的天然狀態呈多棱形，通常是六棱形，長到最佳點就逐漸變細。
當然，並不是每塊天然石英水晶都是完美的，在生長過程中它有可能受到周圍鐵、鋁等大量物質的侵害，結果就出現了色澤上的變化。比如鋁會使水晶變成菸灰色，這樣的水晶被稱爲“煙色石英“；鐵會使水晶變成暗粉色，這樣的水晶被稱爲“玫瑰石英“。除此之外，高強度的輻射也會影響水晶的生長和色澤。只在沒有輻射和其他追蹤元素的地方，纔有可能長出百分之百純淨透明的水晶。