戰爭帶來的破壞是巨大的。王梓統計了整個國境內的損失情況。龜茲國死傷軍民4469人，幾乎涉及了五分之一的家庭，其中積累了多大的仇恨。要想在這樣的國家站住腳，難度可想而知。而且由於國王白商的被殺，將來對於攻佔其他國家也造成了很大困難。因此，諸葛均讓呂秉和覃兵去攻打危須國時，要求他們儘量少殺人，要保住國王極其家人的性命。
諸葛均根據後世的經驗，在龜茲國採取了分化矛盾的方法，將國家之間的矛盾轉化成階級之間的矛盾。具體辦法是，解放奴隸和土地改革。
龜茲國民族衆多，各民族之間的矛盾也很大，國王白商的死也有一個好處，就是國內想要形成較大的有組織的反抗，十分困難。因此龜茲國內的叛亂較少，諸葛均的力量足夠維持他推行改革的需要。他的辦法簡答有效，迅速得到了廣大民衆的支持，從而站穩了腳跟。
校尉城郊20裡的一個名叫馬啓的村子，實行土改的例子 就很典型。
一天早晨，一隊約200人的騎兵突然包圍了馬啓村，他們沒有立即進村，而是派了一個本村的人進去找到村裡的頭人，叫他們把村民都集中在村子的打穀場上。
他們將村子裡有三十畝地以上的人，集中在一起，二十到三十畝地的人就地解散回家。其餘的人集中在一起。結果是地主富農一共11家，被集中關押起來。由一個工作組做工作。其餘的人共146戶，457人。
這457名貧僱農和奴隸，看着周圍拿着刀的士兵，嚇得不知所措，不知道會有什麼厄運降臨到自己頭上。一個官府模樣的人站在石碾子上面，向他們宣佈官府的決定。
內容是，自今日起：
一，所有奴隸全部解放，成爲平民。官府將爲他們辦理公民登記。
二，所有人所欠國家和地主的債務一筆勾銷。
三，地主和富農除了留下30畝地以外，其餘的土地全部充公，平分給這457人。
四，所有人都享有公民權利，可以讀書，做官，從軍。
五，國家對於他們以上的權利給予保護。
聽完官員的公告，臺下一片寂靜。沒有人相信這是真的。這時，一個從焉耆來的原來的奴隸，現在的國防軍班長，現身說法，講解了他的際遇。人們終於相信了，臺下一片哭聲，隨即爆發出一片歡呼聲。
奴隸老嘎原來是一個官員子弟，因爲父親獲罪，全家被賣爲奴，已經12年了，心想着就這樣終老一生了。沒想到還有成爲公民的一天，他跪在地上嚎啕大哭，喊着：“父親，母親，我自由了。”接着站起身來，問士兵們到：“我的母親和姐姐她們在校尉城裡爲奴，也能成爲公民嗎？”士兵們肯定地答覆他到：“能，你可以去找他們。”
村子裡留下幾名士兵和一個指導員，在村子裡選舉了村長，成立了村民協會，進行土地分配。
類似的情況在龜茲各地到處都是，官府迅速得到了廣大的人民的擁護。
關於奴隸主，地主，富農們的改造，王梓想出了一個辦法：辦學習班。學習班的課程，一是講解國家的法律法規，二是講解新型的工商業知識。
其實，對於焉耆的情況，這些奴隸主，地主，富農們已經早有耳聞，知道自己的利益有一定的保障，因此牴觸情緒不是太大。爲了讓他們更好地理解新型的工商業知識，在學習班結束時，在他們中間選了一些代表到焉耆參觀。
焉耆資源豐富，擁有石油、天然氣、銅礦、煤礦、金礦、紅柱石、綠柱石等豐富的礦產資源，在黃月英的主持下，已經得到了開發利用。經過合理規劃，現在焉耆到處是整齊的工業區。各種廠礦，學校，醫院，新式住宅。讓那些前來參觀的土老帽們，大開眼界。
整體來說，國家的變革成果是良好的，權利機構從原來的氏族管理，改造成了國家管理。
經過一個月的整理，國家管理走上了正軌。全國劃分成了五個縣，焉耆，危須，輪臺，鹽城，山國縣。國都仍然在博格達沁城，國號還沿用焉耆。國防軍擴大爲一個軍，三個師，共計18500人，軍長呂秉，三個師長覃兵，甘易和劉漢。
國家的發展勢頭良好，可是諸葛均的心裡卻忐忑不安，二哥諸葛亮一直沒有消息，也不知道是怎麼回事？
忽然，廖洪來到了博格達沁城，諸葛均心裡咯噔一下，感覺很不好。果然，廖洪見到諸葛均，哭喪着臉說到：“我王，出事了，軍師被曹操的人抓走啦。”
原來，襄陽守軍大將夏侯淳接到一個消息，說諸葛亮要經過襄陽，有可能要回他的岳父黃承彥家。夏侯淳得到這個消息非常重視，立即親自佈置了對諸葛亮的抓捕計劃。
因爲沒有人認識諸葛亮，只知道大約30歲左右，身高八尺。爲了保險起見，他安排人秘密監視黃承彥的住處，並在通往西北的邊境上嚴密佈防，凡是見到這個摸樣的人都要嚴加盤查。正在這時，一個陌生人送來了一幅諸葛亮的畫像。
夏侯淳立即命人臨摹了許多份，發到了官兵們的手裡。
諸葛亮在進入黃承彥家之前，化妝成了一個郎中摸樣的人，臉上沾着鬍子，還貼了膏藥。但是許多捕快經驗豐富，根據身高等條件，感覺此人可疑。後來黃承彥家又陸續來了不少陌生人，基本上斷定是諸葛了來了。
第二天，黃承宗來了，還帶着一個商隊。從黃承彥家出來出來幾個人，和商隊一起出發了。
他們走出了大約十幾裡，突然被一大隊官兵包圍了，他們檢查了黃承彥身邊的人，沒有發現諸葛亮，這時，一個軍官走向最前面那個駝背的牽馬人，認出來化妝的諸葛亮。廖洪沒有上前，知道這樣沒有用。官兵們一陣歡呼，沒有理會其他人，帶着諸葛亮走了。廖洪留下人跟蹤着官兵們，自己就跑來報信了。
諸葛均聽到這裡，身子一陣搖晃。心道：“都是自己不好，如果不是自己破壞諸葛亮的計劃，他在劉備哪裡呆的好好的，怎麼會被曹軍抓走呢？”他痛苦萬分，不知道如何向黃月英交代。