仙台藩公開俸祿爲六十二萬石，但仙台藩的地理位置得天獨厚，領內有仙台平原，另有石卷、氣仙灣、女川河盛產水產品。仙台藩經濟發達，實際石高收入一度高達兩百萬石，成爲當時東瀛收入最高的藩國。
仙台藩的現任藩主爲伊達忠宗，娶德川氏一門的女性做妻子，與幕府之間建立了強而有力的關係。仙台藩作爲幕府最忠實的支持者，仙台藩近一半的兵力被調往了江戶，這爲九州奪取仙台藩創造了條件。實際上這個情況在東北各個藩都存在。當九州大軍在本州東北肆虐的時候，東北各藩只能求自保，而無法對其他藩進行援助。
伊達忠宗也無力單獨對抗九州的大軍，他只得實行收縮防守，將兵力全部集中到仙台城一帶，以守待援。
六月六日，鄭芝虎率領的八萬大軍從北方進入了仙台城附近。八日，施大瑄率領的九州與久保田的五萬聯軍也進入仙台城附近，至此兩軍對仙台城完成了合圍。
仙台城是依青葉山建造的連郭式平山城，伊達政宗在建造仙台城之時，爲了防止將軍德川家康的警戒，他甚至都沒有設天守閣，可見此城的防禦力並不高。但在盛岡城屠城之後，使得仙台城上下對此次防守都報着必死的決心。
九日，在九州猛烈的炮火轟擊之下，九州大軍便奪取了三之丸，但在三之丸遭遇九州軍遭遇到了激烈的抵抗，城內的居民都加入了對九州軍的戰爭，九州軍在進入三之丸之後，又被仙台藩的守軍和居民給驅趕了出來。
“大人，城內的抵抗非常激烈，我軍進入三之丸之後，面對來自城內各種勢力的抵抗，甚至婦孺都加入了其中，使得我軍不得不退出仙台城。”佐竹義隆第一次爲九州軍作戰，卻沒想到卻遭遇了一個小挫折，這讓他非常鬱悶。
“大人，我建議用火攻，我軍不能在仙台城逗留太久，根據消息，現在幕府的援軍已經在路上了。”施大瑄建議道。
“大人，如果使用火攻的話，仙台城恐怕會毀於一旦。”佐竹義隆輕聲道。
“現在沒有其他辦法，我軍五日之內必須拿下仙台城，這樣才能趕在幕府援軍抵達之前，完全佔領東北部。”施大瑄不以爲然道。
“那就用火攻，明日的攻城由施都督來負責，拿下仙台城之後雞犬不留，我要所有人知道，敢抵抗九州大軍者，唯有死路一條。”鄭芝虎惡狠狠地道。
“諾。”
……
次日，施大瑄率領兩萬大軍再次攻入了三之丸。施大瑄不同於佐竹義隆，他攻入三之丸之後，首先開始縱火，然後見人就殺，一時間三之丸成了人間地獄。在施大瑄的屠殺和驅趕之下，走投無路的三之丸居民被逼着往二之丸逃去。而三之丸的大火也蔓延到了二之丸。
施大瑄在奪取三之丸之後，並沒有立刻對仙台城的二之丸發起攻擊，而是退出了三之丸，在城外進行修整，現在三之丸在一片大火之中，根本無法逗留。
三之丸的大火一直燒到了晚上才逐漸熄滅，整個三之丸變成了一片廢墟，就連二之丸都被燒燬了三分之一。
十一日，施大瑄對二之丸發起了攻擊，相對於三之丸，施大瑄感覺對二之丸的攻擊要輕鬆許多，也許是昨天仙台城的居民被九州軍殺怕了，施大瑄的大軍勢如破竹一般就奪取了二之丸。
十二日，九州大軍又奪取了仙台城的本丸。雖然本丸抵抗非常激烈，但面對士氣高昂的九州軍，本丸的守軍也僅僅抵抗了大半天的時間。
奪取仙台城之後，爲了報復仙台城的百姓，鄭芝虎下令緊閉四門，全軍對仙台城進行了屠城。十五萬大軍同時進行屠城，僅僅兩天之後，整個仙台城就被屠戮一空，最後仙台城存活下來的只有一萬多婦人，這還是鄭芝虎下令留下來的。
奪取仙台藩，爲九州大軍提供充足的糧餉，而奪取仙台城所獲的財富足以彌補此次出征幕府全部的軍餉。到現在鄭芝虎才明白真正的以戰養戰說到底就是劫掠，而屠城是以戰養戰的最高境界。
奪取仙台藩，使得搖擺中的米澤藩改旗易幟，宣佈加入九州軍。米澤藩的上杉氏在關原之戰之前一直與德川氏處於敵對狀態。在德川家康奪取天下之後，上杉氏受到了處罰，雖然德川家康沒有全部沒收上杉氏的領土，但卻將其石高降到三十萬石，這使得上杉氏對幕府的忠誠度一直不高。
米澤藩的投降，使得整個本州東北再也沒有力量抵抗九州大軍。九州大軍開始積極地從進攻轉入防守，準備防禦從江戶派出了十萬的大軍。
而九州軍裝備了先進的天啓槍的消息此刻也傳到了江戶，使得從江戶出來的援軍改變了初衷，從進攻變成了防守。而幕府也開始積極尋求購入天啓槍，只不過大明與九州的關係緊密，幕府無法從大明購入天啓槍，他們不得不想辦法想從西洋人手裡購入天啓槍，而西洋人的天啓槍纔開始換裝，他們現在連自己都無法滿足。
失去本州的東北，使得整個關東地區都暴露在九州大軍面前，而且使得本來財政就困難的幕府現在更加困難，在接連不利的消息之下，德川家光病倒了。
到十月，德川家光的病情持續加重，十月二十日，德川家光病逝。德川家光比原本的歷史提前數月離開了人世。在臨死之際，德川家光把保科正之喚到枕邊，將年僅九歲的四代將軍德川家綱託付給他。
保科正之感念德川家光的重視之恩，極力輔佐德川家綱。在保科正之和大老酒井忠勝，老中鬆平信綱，阿部忠秋的輔佐下，德川家綱正式成爲了第四代徵夷大將軍，這也是這個時空，德川幕府的最後一任將軍。
在得知德川家光病逝，年僅九歲的德川家綱繼位的消息之後，鄭芝龍再次準備討伐幕府。