依靠漢人、安撫土著、搜查金銀珠寶，是鄭芝龍征服臺灣每一個城堡後，不變的三步曲，現在的臺灣，西班牙人已經死絕了，南部只有數百荷蘭戰俘，其餘的全部是土著與漢人。
據鄭芝龍估計，土著大約有十萬人，他們大多是不同時期從大陸渡海而來，只是他們失去了自己的歷史，如果有家譜，不知道能不能找到他們的祖先。
不過，從他們的方言當中可以看出，這些人說的話與閩南語非常相近，相互之間能勉強聽得懂對方的話語，應該從福建來的居多，福建與臺灣，只隔着一條狹窄的海峽。
至於漢人，大約有三萬，他們說的是正宗的閩南語，應該從福建來的時間還不長，如果時間久了，他們的方言可能要發生一些變化，到時候又可能找不到自己的祖先了。
如果現在不及早歸化，將來臺灣島民智得到開發，會不會脫離大陸自立，誰也說不準，畢竟臺灣是孤懸在海上，與大陸隔着一道比心還寬的海峽。
鄭芝龍要做的，先要讓漢人歸心，再利用漢人與土著的和睦關係，一步步同化當地的土著，當然，他只是軍人，只能做好現在的事。
在大明的地方官員來到臺灣之前，南海艦隊充分利用當地的漢人，協助陸戰隊在各地建立地方軍政府，初步有效統治臺灣各地。
等朝廷向臺灣派來大批的地方官員後，南海艦隊就會從軍政府中撤出，將臺灣交給這些文官們，南海艦隊還是要回歸到征伐的本色當中。
在朝廷派來的官員到達之前，南海艦隊已經佔據了整個臺灣島。
樑用的陸戰第十旅駐紮在臺灣南部，以大員爲中心，城堡還包括汕尾，附近村落由於遭到荷蘭人的欺凌，在明軍到來之後，由於漢人的引導下，土著也能親近大明。
吳才茂的陸戰第十一旅，已經完全蕩平了大肚王國，建立以彰化城爲代表的統治中心，但在此處，由於明軍採用了高壓政策，當地土著只是表面上歸附，統治極不穩定。
北部地區，駐紮的是金會的陸戰第十二旅，師長鄭興暫時也在這兒，西班牙人修築的聖多明戈城和聖薩爾瓦多城都被明軍接管，這裡的百姓曾經受到西班牙人奴役，與南方的境況差不多，當地的百姓，無論是漢人還是土著，都是比較親近大明。
鄭芝龍要抹去西班牙人曾經統治過的痕跡，他將聖多明戈城依照附近的河流，更名淡水城，聖薩爾瓦多城改用原來的名稱，雞籠，但他認爲，‘雞籠’這個名字，太過土氣，難登大雅之堂，遂用了同音字：基隆。
三個陸戰旅通過臺灣西海岸加強聯繫，相互協作。
爲了防止荷蘭人與西班牙人從南洋派出艦隊，前來報復，鄭芝龍將南海艦隊集中到大員港口，同時傳令，滯留在廣州與廈門的南海艦隊餘部，儘快趕到大員，與他匯合。
在清理財產的時候，鄭芝龍發現，聖多明戈城與聖薩爾瓦多合在一起，都比不上一個熱蘭遮城，兩城這僅僅搜出價值五
十萬兩的金銀，加上城中的財物和港口商船上的貨物，價值也不過八十萬兩左右。
而熱蘭遮城一座城堡，就搜出價值一百二十萬兩的金銀財物，如果荷蘭東印度公司願意用每人五百兩贖買人質，又有三十萬的收入。
西班牙在臺灣的貿易，已經遠遠不如荷蘭，由此可見，雙方在東方的貿易對比。
在京師的時候，朱由檢曾經口授鄭芝龍，讓他在臺灣和南洋地區蒐集西夷的火器、技術和書籍。
通過與大明的對比，鄭芝龍發現，荷蘭與西班牙的火炮，口徑比大明的略小，射程也近，使用的還是實心彈，他們的的火槍還停留在火銃階段，比大明的燧發槍整整落後了一代，對大明沒有多少借鑑作用。
在海軍的艦船方面，西班牙在臺灣僅有的幾艘艦船，已經被鄭興一怒之下，全部擊沉了，失去了比較的可能，荷蘭的艦船，噸位比大明的廣船小，火炮的數量卻比廣船多，結構上肯定有一些參考的價值，不過鄭芝龍已經爲大明找了一位精通造船技術的荷蘭人斯特恩。
斯特恩現在已經去了福州的造船廠，參與大明的艦船射擊，但鄭芝龍還是將俘獲的荷蘭艦船開往福州，必要的時候給斯特恩作爲參考。
關於科學方面的書籍，鄭芝龍倒是搜出幾本，主要是孩子們學習的書籍，他命人在荷蘭人的協助下，翻譯成漢語，爲了防止翻譯上的錯誤，鄭芝龍是命令兩套人馬分別翻譯，等完工後一併送至京師，但這個過程時間比較長，不是幾天就能完工的。
鄭芝龍給國防院發出軍報。
在軍報中，鄭芝龍不僅彙報了臺灣的戰況，也彙報了剿滅大肚王國的事，最後，他向國防院建議，從福建抽調陸軍駐紮臺灣，南海艦隊只能駐紮在大員，無法駐紮在整個臺灣。
臺灣戰爭順利結束之後，鄭芝龍遵守了自己的諾言，釋放了荷蘭駐臺灣的最高長官普特曼斯，讓他回到巴達維亞。
接到南海艦隊的戰報，李春燁絲毫不敢怠慢，他立即入宮，求見朱由檢。
看了南海艦隊的軍報，朱由檢似乎不敢相信自己的眼睛：“候質，你說這鄭芝龍，到底打的是什麼仗，這麼快就平定臺灣了？”
“陛下，鄭芝龍膽子再大，也不敢在這件事情上欺瞞陛下吧？”李春燁有自己的判斷，如果鄭芝龍晚幾天打下臺灣，沒有人認爲他作戰不力，也不會影響他的軍功，整個朝廷，除了朱由檢與國防院，恐怕找不到幾個關心臺灣的人。
“鄭芝龍還不敢欺瞞朕，朕只是覺得，南海艦隊的進軍速度，似乎比陸軍還快。”朱由檢就像是毛頭小子初婚，沒入洞房的時候，天天盼着入洞房，跟猴急似的，真要入了洞房，也就那麼回事，反而少了幾分興奮，期待永遠比得到更加刺激。
“陛下是說，鄭芝龍推進得太快了？”李春燁咧嘴大笑，“臺灣是一個獨立的島嶼，就是推進得快點，應該也不會有什麼後遺症，難道當地的土著會展開反撲？”
“朕倒不是
這個意思，土著連數百荷蘭人都打不過，難道還能打得贏大明的上萬士兵？”朱由檢微笑着搖頭，臺灣戰爭，他知道一定會勝利，但沒想到勝利來得如此之快，“朕是說，這才一個月的時間，鄭芝龍就平定了臺灣，人事部怕是還沒安排好赴臺灣上任的官員。”
“陛下……”李春燁也是笑，“臺灣既已收回，今後如何納入大明的地方管理？”
“臺灣的管理，自然是立省。”朱由檢一副雲淡風輕的樣子。
“立省？應該是大明的第二十三個省，”李春燁板起手指頭，快速數了一下，“陛下，臺灣乃彈丸之地，要是立省，地域是不是太小了？”
“太小？不會。”朱由檢拿出一份新近繪製的《大明疆域圖》，“朕還是信王的時候，候質就知道朕對大明的展望，現在候質知道朕爲什麼發展海軍嗎？”
“海軍自然是維護大明的疆域，爲大明的商隊護航。”李春燁知道，朱由檢從來不會爲了排場，做些沒有意義的事，他發展海軍，絕對不會是爲了宣揚大明的所謂國威。
“候質說得不錯，”朱由檢差點就說出‘知我者，候質也’，“可是，要維護大明海疆的安全，爲出海的商人護航，海軍必須要進入大海，候質看這份《大明疆域圖》，看看大明面向大海的東部，有什麼感想？”
李春燁接過朱由檢遞過的《大明疆域圖》，與普通的《大明疆域圖》不同，這份《大明疆域圖》的東面，向外擴展了很遠，“陛下，這琉球的東面，這蔚藍色的部分，到底是什麼？”
“大海，這纔是真正的大海。”
“大海？”李春燁瞪大眼睛，他發現，琉球島的東面與西面，是一樣的蔚藍色，“陛下，難道琉球的東面，也是大海？”
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“當然，候質你看，大明與琉球之間，就是我們常說的大海，但是，如果大海僅僅在這兒，那大明的海外貿易，也只能是大明與琉球之間的貿易，以琉球的彈丸之地，這些貿易能抵得上大明一個府，就頂天了。”
“陛下，大明的海外貿易，不是在南方嗎？”
“候質只是說對了一半，”朱由檢先是用手指畫出南方的貿易通道，基本上就是當年鄭和航行的路線，“這一條貿易路線，早已存在，是西夷最近纔開闢的，但是，漢人早就發現了，稱爲‘海上絲綢之路’，只是因爲朝廷不重視海外貿易，這才逐漸廢止了。”
“陛下，南海艦隊將來開闢的就是這條貿易路線？”
“嗯，鄭芝龍在南洋行商多年，他知道這條貿易路線的巨大利潤，以及對大明的重要性，”朱由檢指着《大明疆域圖》上沿途的口岸，“可是，候質看看，這條貿易路線，對大明來說非常狹窄，要是沿途出現一個稍微強大的國家，這條貿易路線就可能被掐斷。”
李春燁從廈門、廣州開始，一路看下去，果然沿途的出口很少，也很狹窄，貿易路線很容易被別人攔腰斬斷，“陛下，這些島嶼，大明有辦法去除嗎？”
（本章完）