接着，宇文化及就主持朝政，商議立帝之事。牛方裕、薛世良等人想立蜀王楊秀，卻遭到關押過蜀王的御林軍將領們強烈反對。宇文化及清楚他們的厲害，不敢得罪他們，就採納宇文智及、司馬德戡、裴虔通、趙行樞等人的意見，決定立秦王楊浩爲帝。朝堂中也有人反對，他們以爲楊浩無才無德，平庸無能，不適合當皇帝。然因宇文化及兄弟跟楊浩來往密切，關係甚好，他們欲扶楊浩坐上皇位。
經過一番爭議，末了宇文化及以丞相的職權強行拍板，並假蕭皇后懿旨立秦王爲帝。那些持異議者深知宇文化及陰險毒辣，怕得罪他而遭遇許善心的悲慘下場，也就紛紛轉過向兒，表示支持丞相的決定。特別是裴矩，他極力反駁異議者而力挺宇文化及。這令宇文化及非常高興，不僅免了他的罪，還當即提拔他爲右僕射。這可把裴矩樂得心花怒放，撲通一聲跪地就叩首拜謝，一臉的媚態。
隨後，宇文化及任命弟弟宇文智及爲左僕射、宇文士及爲內史令、司馬德戡爲溫國公，加光祿大夫，並大批任用自己的親信。與此同時他盡力排除異己，殺掉蜀王楊秀、齊王楊暕等隋氏宗室和外戚沈光以及張琮、錢傑等反對者數十人。自此，朝中之事無論鉅細，皆由宇文化及兄弟裁奪，而皇帝楊浩只是宇文化及手中的一顆號令天下的棋子，一個擺設而已。
宇文化及身爲朝中丞相，卻據有六宮，奉養一如隋煬帝，享受着帝王的尊貴和奢靡生活，行使着帝王至高無上的權力。宇文化及野心極大，當然不能滿足於偏隅一方，他想趕緊率軍回長安，趁唐王李淵還沒行動之前把他幹掉，自己好上位。因此，準備數日後，宇文化及就命司馬德戡率大部隊掠奪江都人的船隻，然後從彭城出發，沿水路向長安進軍。宇文化及生怕李淵聞說隋煬帝已死，廢了隋恭帝楊侑而捷足先登帝位。因此，他一路令將士日夜兼程，朝長安風風火火趕去。可惜的是剛行走不久，水路就不通，只得改走陸路。
一路上，宇文化及命車馬載宮中美女和珍寶，而令軍士揹負戈甲器械。軍士行過一段長路之後，極爲疲勞，就開始怨聲載道，軍心漸散。司馬德戡見機，欲起兵謀反，殺掉宇文化及，更立自己爲主。然事還未起，忠於宇文化及的許弘仁、張愷就向丞相揭發了司馬德戡、趙行樞等人的陰謀。宇文化及當即用計誘殺了司馬德戡，平定了叛亂。接着，宇文化及率衆繼續西行，然到鞏洛時被李密的軍隊阻斷了去路。因此，宇文化及不得前行，只好率軍向東郡行走。
在宇文化及率部向京師長安進發之時，李建成、李世民兄弟倆已揮師抵達東都，駐紮在芳華苑。王世充聽說李建成率十萬餘軍前來增援，不喜反而憂懼，因爲他猜到了李淵的真正用意，那就是想要藉機佔領東都。他當然不想讓李淵的陰謀得逞，因此當越王楊侗、元文都等人眉開眼笑，準備迎接李建成軍進城時，王世充堅決反對。他挑唆楊侗，說李建成率大軍前來，其目的並非真心替越王趕跑李密，而是要藉機殺掉越王，佔有東都。楊侗向無主見，一切皆聽王世充。因而猶疑了半天，楊侗最後還是聽從王世充的勸諫，下令閉門不開，命李建成的部隊駐守城外，以抗擊李密。
對此，李建成很生氣，大罵王世充爲奸賊。一恕之下，李建成想率兵攻打東都，斬殺王世充，以泄心頭之恨。不過，這時李世民相當冷靜，清楚這樣做一定會讓李密坐獲漁人之利，而自己不僅佔不住東都，且得大傷元氣。因此，他堅決制止李建成這一魯莽行爲，說義軍平定關中不久，根基尚未牢固，即使能攻取東都，也無法守住，到時倒讓虎視眈眈的瓦崗賊軍得了便宜。爲今之計，最好的對策就是讓李密與王世充互鬥，自損軍力，待時機成熟，再殺回來也不遲。李建成聽了這席話後，也深覺有道理，就同意了李世民的建議，不攻東都，當即下令班師回長安。
王世充見李建成的部隊拔寨起營，就令段達、董浚率兵追擊，不幸在三王陵處遭到李世民的埋伏。李世民與段達大戰一場，斬敵四千餘人。段達、董浚藉機逃脫，倖免於難。李建成見李世民料敵如神，算準了王世充會趁自己撤兵之際偷襲，從而設下埋伏。獲此大捷，他心裡着實很高興，同時又泛起般酸酸澀澀的滋味，有點妒嫉弟弟的才能了。
接着，李建成又率軍經過不久前平定的新安、宜陽二郡。他們本想在此休整幾日，然從探報中獲知宇文化及率軍向長安一路進發。李世民當即建議大哥連夜行軍，不得休息。李建成也感到事態的嚴重性，便立即下令部隊重新出發，以最快的速度行軍，好趕在宇文化及之前達到長安，協助父親抵禦宇文化及。
十餘日後，李建成和李世民便回到了長安。李淵看見兒子們得勝回朝，心裡甚是歡欣，因爲他們兄弟二人此等圓滿完成了自己所佈置的任務，取下以東數郡，爲往後東進打下了比較堅實的基礎。這是一次重大的勝利，爲此李淵大賞李建成兄弟和段志玄等將佐，並犒勞三軍將士。
然而，李世民無心爲自己的功勞和獎賞沾沾自喜，那張豐滿而英俊的臉龐上露出一絲憂愁，時不時對着陽光明媚的天空輕聲嘆息。房玄齡把這一切都看在眼裡，他揣測到李世民爲何而煩心了。一日晚上，藉故邀李世民對弈。李世民剛練了通書法，覺得無所事事，就令侍從於書房之中設案擺棋。接着，兩人相對而坐，一邊下棋，一邊閒談。過了會兒，李世民不知突然想到了什麼，禁不住輕嘆一聲。房玄齡趁機笑問道：
“趙公爲何而嘆息呢？這幾日，玄齡常聞趙公嘆氣，不知是爲何事而煩憂。可否告知在下，讓玄齡爲您分擔一二？”